相对于丰富的野生动植物资源来说，巴拉圭的矿产资源很少。巴拉圭的土壤缺乏矿物形成的营养物质，这种缺乏与丰富的动植物资源形成鲜明的对比。盐矿和石灰石储量较大，还有少量铁、铜、锰、铁钒土、云母、鈮、石油、铝矾土等。巴拉圭储藏的砂石和石灰石有可资利用的商业价值。可以制成砖的黏土到处可见。作为建筑和装饰材料的大理石和蛇纹岩储量丰富，很有开发价值;还有菱镁矿和铜矿，虽储量有限，但都是富矿，目前还没有得到开发。

巴拉圭水资源丰富，不但河流众多，而且水量都比较大，尤其许多河流从高原流下，水利资源十分丰富。在与巴西交界的巴拉那河上，巴西与巴拉圭在联合国有关机构的支持下兴建的伊泰普水电站，是迄今世界上最大的水电站。此外，巴拉圭还同阿根廷共同兴建了许多水利工程，如1947年发电机组全部安装完毕的亚雷西塔水电站，总装机容量为370万千瓦时。